Wprawdzie wszystkie dane ze świadectwa charakterystyki energetycznej wynikać powinny z dokładnie sprecyzowanej oraz przyjętej przez Ministerstwo Infrastruktury w dniu 06.11.2008 r. metodologii obliczeniowej, jednak przykłady wzięte z innych krajów unijnych, w których dyrektywa weszła już w życie dowodzą, iż w zależności od kwalifikacji audytorów energetycznych - certyfikatorów, wyniki badań mogą się wzajemnie od siebie różnić.

Zgodnie z projektem ustawy Prawo Budowlane i w trosce o rzetelność i objektywność danych wynikających ze sporządzonego certyfikatu, przewidziany jest tzw. "rejestr negatywny", a więc wykaz tych osób uprawnionych do sporządzania świadectw, które nie dopełniły swych obowiązków oraz naruszyły zakazy o których mowa w art. 52 ust. 2 i 4. Na wniosek odpowiedniej komisji zaistnieć może dla ministra podstawa do wydania decyzji o utracie uprawnień do sporządzania świadectw charakterystyki energetycznej osoby, wobec której w toku postępowania wyjaśniającego ustalono niedopełnienia obowiązków i naruszenie zakazów.